本专项重点针对人与动植物等新发突发传染病疫情、生物技术谬用、外来生物入侵、实验室生物安全，以及人类遗传资源和特殊生物资源流失等国家生物安全关键领域，开展科技攻关，实现基础研究、共性关键技术与重大产品研发、典型应用示范的突破，推动我国生物安全科技支撑能力达到国际先进水平。
2018 年项目申报指南秉承实施方案的总体思路，坚持整体与局部相结合、共商共议、查漏补缺等原则，拟在共性关键技术及重大产品研发、典型应用示范等两项任务部署 2 个定向指南方向，为保证资助强度，每个研究方向原则上只支持 1 个项目，国拨经费总概算数约为 0.7 亿元。鼓励产学研用联合申报，项目承担单位有义务推动研究成果的转化应用。